Теорія хаосу продовжує захоплюючу історію «Шістки Нублара», яка стикається з новими загрозами та розплутує зловісні змови у світі торгівлі динозаврами. Після шокуючої зради Бруклін у другому сезоні, група залишається в розгубленості, намагаючись зрозуміти її мотиви та виплутатися з небезпечних ситуацій.
Бруклін, яка тепер працює під прикриттям у злочинній мережі Сойони, стає свідком жахливих сцен знущань над динозаврами та на гладіаторських аренах. Її місія з викриття діяльності Сойони стає дедалі небезпечнішою, адже вона ризикує життям, щоб зібрати докази. Тим часом Кенджі та Даріус розпочинають місію, щоб знайти Бруклін і повернути її, що призводить до міжособистісної драми та романтичної напруженості в групі.