Шостий сезон Декстера, що стартував 2 жовтня 2011 року, складається з 12 серій і заглиблюється в теми віри, моралі та спадщини. У центрі сюжету — новий серійний убивця, натхненний релігійними символами, а також особисті пошуки самого Декстера.
Новим антагоністом стає так званий "Убивця Судного дня" — Тревіс Маршалл, який діє під впливом свого наставника, професора Геллара. Разом вони здійснюють серію ритуальних вбивств, натхненних апокаліптичними образами. Згодом з’ясовується, що Геллар — лише галюцинація, породжена розумом Тревіса. Паралельно Декстер знайомиться з Братом Семом, колишнім злочинцем, який знайшов шлях до віри. Це змушує Декстера задуматися про можливість змінити свою сутність і залишити позитивну спадщину для сина.
Дебра отримує підвищення до лейтенанта, що виводить її на новий рівень відповідальності, але також змушує звернутися до психотерапії, де вона починає осмислювати свої стосунки з братом. Квінн, переживаючи розрив з Деброю, занурюється в саморуйнівну поведінку, що впливає на його роботу в департаменті.
